執行部等
副総長等
副総長（統括・医学系連携担当）
門松 健治
副総長（財務・施設・Development Office・広報ブランディング担当）
木村 彰吾
副総長（研究・情報系戦略（研究）担当）
山中 宏二
副総長（教育・留学生・情報システム（DU）・情報系戦略（教育/その他）担当）
寺崎 一郎
副総長（国際、計画・評価、IR担当）
水谷 法美
副総長(産学官連携・スタートアップ担当)
佐宗 章弘
副総長（学生支援・入試・人文社会系改革・図書館・附属学校担当）
佐久間 淳一
副総長（法務・リスク管理・公正研究・内部統制・監査・人権担当）
矢野 昌浩
副総長（男女共同参画・多様性担当）
永田 雅子
教育研究評議会評議員
（令和7年4月1日現在）
| 機構長 | 松 尾 清 一 |
|---|---|
| 総 長 | 杉 山 直 |
| 理事（統括副総長） | 門 松 健 治 |
| 理事（副総長） | 木 村 彰 吾 |
| 副総長 | 寺 崎 一 郎 |
| 人文学研究科長 | 星 野 幸 代 |
| 教育発達科学研究科長 | 高 井 次 郎 |
| 法学研究科長 | 中 東 正 文 |
| 経済学研究科長 | 清 水 克 俊 |
| 情報学研究科長 | 北 栄 輔 |
| 理学研究科長 | 田 中 健太郎 |
| 医学系研究科長 | 勝 野 雅 央 |
| 工学研究科長 | 小 橋 眞 |
| 生命農学研究科長 | 中 園 幹 生 |
| 国際開発研究科長 | 島 田 弦 |
| 多元数理科学研究科長 | 大 平 徹 |
| 環境学研究科長 | 谷 川 寛 樹 |
| 創薬科学研究科長 | 山 本 芳 彦 |
| 教養教育院長 | 納 谷 信 |
| 高等研究院長 | 榊 原 均 |
| 環境医学研究所長 | 林 良 敬 |
| 未来材料・システム研究所長 | 内 山 知 実 |
| 宇宙地球環境研究所長 | 塩 川 和 夫 |
| 医学部附属病院長 | 丸 山 彰 一 |
| ジェンダーダイバーシティセンター長 | 山 﨑 真理子 |
| 総合保健体育科学センター長 | 石 田 浩 司 |
| 連合Ⅰ群選出評議員(教育基盤連携本部） | 加 藤 真 紀 |
| 連合Ⅱ群選出評議員(情報基盤センター長) | 森 健 策 |
| 評議会選出評議員 | 池 田 素 子 |
| 評議会選出評議員 | 田 川 美 穂 |
| 評議会選出評議員 | 竹 本 さやか |
| 評議会選出評議員 | 中 村 靖 子 |
| 評議会選出評議員 | 服 部 美 奈 |
| 評議会選出評議員 | 本 田 育 美 |
| 評議会選出評議員 | WANG Qian |